在大和尚“教理、禅定、福德”三环一体的教育理念下，学院开设戒、定、慧三学兼备的诸类课程，使学僧能有系统的循序渐进，一步步深入佛法的堂奥；更以宗门心法的薰习，冀能顿见自性，直契佛心。

• 佛学──
  由导师　上惟下觉大和尚亲自指导禅修及研究课程，其中戒律学、佛法纲要、八宗纲要、唯识学、教观纲宗、楞严经、大乘起信论、禅宗、经论研讨、观行、梵呗等为必修课程，并配合幻灯片教学，复讲，报告，笔记，作业，背诵，户外教学及电脑等方式。如此扎实的薰修，必能使学僧应机契理，妙冥心印，深入佛智。
  
  
• 世学──
  佛法不离世间法，菩萨向五明处学，弘法利生须要博学多闻，故佛学院除了佛学课，还开设了国文、文字学、四书、古文观止、英文、电脑、书法、国画、美工……等世学课程，充实学僧行菩萨道之资粮，使佛法更具有时代精神。

• 禅者，佛之心。佛学院的课程，着重教观双运，解行并重。学僧必须熟悉数息观、不净观、慈悲观、四念处及中道实相观等各种观行，每天除了早晚课诵坐香外，每天上午另有一小时的静坐课，并每月定期举办一日禅、每学期举办三日禅及精进禅七。

• 日常作务──

  山中忙碌有生涯 此外别无玄妙事

  学僧每日有固定坡事，藉由环境清洁、大寮、行堂轮值等种种坡事发心，不仅养成勤劳、务实的美德，更能将佛法落实于日常生活中，体会事理圆融，动静一如的修行。
  
  
• 法会训练──

  静则一念不生 动则万善圆彰

  中台山寺的法会多由学僧参与筹划执行，一者训练领导能力，二者学习各种职司经验，三者增长福德资粮，四者动中磨练。不同的法会及职司薰修，不是课外活动，而是日用修行，广植福慧资粮的重要课程。